Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VtnP29788 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VtnP29788 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VtnP29788 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VtnP29788 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VtnP29788 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VtnP29788 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
VtnP29788 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VtnP29788 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VtnP29788 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VtnP29788 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VtnP29788 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VtnP29788 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VtnP29788 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VtnP29788 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VtnP29788 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VtnP29788 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VtnP29788 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VtnP29788 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VtnP29788 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VtnP29788 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VtnP29788 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VtnP29788 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VtnP29788 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VtnP29788 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VtnP29788 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VtnP29788 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VtnP29788 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VtnP29788 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VtnP29788 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VtnP29788 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VtnP29788 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VtnP29788 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
VtnP29788 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VtnP29788 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VtnP29788 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VtnP29788 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VtnP29788 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VtnP29788 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VtnP29788 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VtnP29788 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VtnP29788 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VtnP29788 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VtnP29788 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
VtnP29788 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VtnP29788 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
VtnP29788 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VtnP29788 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VtnP29788 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VtnP29788 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VtnP29788 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VtnP29788 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VtnP29788 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VtnP29788 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VtnP29788 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VtnP29788 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VtnP29788 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VtnP29788 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VtnP29788 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VtnP29788 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VtnP29788 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VtnP29788 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VtnP29788 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VtnP29788 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VtnP29788 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VtnP29788 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VtnP29788 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
VtnP29788 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VtnP29788 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VtnP29788 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VtnP29788 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VtnP29788 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VtnP29788 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VtnP29788 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VtnP29788 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VtnP29788 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VtnP29788 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VtnP29788 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
VtnP29788 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VtnP29788 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VtnP29788 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VtnP29788 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VtnP29788 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VtnP29788 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VtnP29788 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VtnP29788 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VtnP29788 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VtnP29788 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VtnP29788 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VtnP29788 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VtnP29788 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VtnP29788 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VtnP29788 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VtnP29788 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VtnP29788 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VtnP29788 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VtnP29788 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VtnP29788 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VtnP29788 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VtnP29788 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms