Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NapbP28663 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NapbP28663 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NapbP28663 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NapbP28663 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NapbP28663 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NapbP28663 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NapbP28663 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NapbP28663 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NapbP28663 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NapbP28663 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NapbP28663 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NapbP28663 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NapbP28663 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NapbP28663 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NapbP28663 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NapbP28663 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NapbP28663 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NapbP28663 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NapbP28663 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NapbP28663 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NapbP28663 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NapbP28663 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NapbP28663 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NapbP28663 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NapbP28663 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NapbP28663 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NapbP28663 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NapbP28663 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NapbP28663 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NapbP28663 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NapbP28663 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NapbP28663 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NapbP28663 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NapbP28663 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NapbP28663 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NapbP28663 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NapbP28663 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NapbP28663 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NapbP28663 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NapbP28663 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NapbP28663 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NapbP28663 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NapbP28663 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NapbP28663 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NapbP28663 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NapbP28663 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NapbP28663 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NapbP28663 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NapbP28663 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NapbP28663 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NapbP28663 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NapbP28663 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NapbP28663 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NapbP28663 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NapbP28663 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NapbP28663 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NapbP28663 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NapbP28663 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NapbP28663 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NapbP28663 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NapbP28663 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NapbP28663 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NapbP28663 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NapbP28663 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NapbP28663 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NapbP28663 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NapbP28663 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NapbP28663 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NapbP28663 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NapbP28663 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NapbP28663 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NapbP28663 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NapbP28663 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NapbP28663 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NapbP28663 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NapbP28663 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NapbP28663 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NapbP28663 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NapbP28663 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NapbP28663 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NapbP28663 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NapbP28663 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NapbP28663 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NapbP28663 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NapbP28663 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NapbP28663 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NapbP28663 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NapbP28663 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NapbP28663 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NapbP28663 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NapbP28663 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NapbP28663 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NapbP28663 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NapbP28663 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NapbP28663 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NapbP28663 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NapbP28663 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NapbP28663 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NapbP28663 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1331.3 ms