Protein–RNA interactions for Protein: P28661

Sept4, Septin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept4P28661 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sept4P28661 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sept4P28661 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sept4P28661 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sept4P28661 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sept4P28661 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Sept4P28661 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Sept4P28661 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sept4P28661 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sept4P28661 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sept4P28661 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Sept4P28661 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sept4P28661 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sept4P28661 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sept4P28661 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sept4P28661 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sept4P28661 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sept4P28661 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sept4P28661 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sept4P28661 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sept4P28661 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sept4P28661 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Sept4P28661 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Sept4P28661 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sept4P28661 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sept4P28661 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sept4P28661 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sept4P28661 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sept4P28661 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sept4P28661 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sept4P28661 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sept4P28661 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sept4P28661 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sept4P28661 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sept4P28661 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sept4P28661 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sept4P28661 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sept4P28661 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sept4P28661 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sept4P28661 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sept4P28661 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sept4P28661 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sept4P28661 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sept4P28661 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sept4P28661 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sept4P28661 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sept4P28661 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sept4P28661 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sept4P28661 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sept4P28661 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sept4P28661 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sept4P28661 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sept4P28661 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sept4P28661 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sept4P28661 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Sept4P28661 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sept4P28661 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sept4P28661 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sept4P28661 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sept4P28661 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sept4P28661 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sept4P28661 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sept4P28661 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sept4P28661 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sept4P28661 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sept4P28661 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sept4P28661 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sept4P28661 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sept4P28661 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Sept4P28661 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sept4P28661 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Sept4P28661 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sept4P28661 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sept4P28661 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sept4P28661 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sept4P28661 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sept4P28661 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Sept4P28661 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sept4P28661 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sept4P28661 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sept4P28661 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sept4P28661 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sept4P28661 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sept4P28661 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sept4P28661 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sept4P28661 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sept4P28661 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sept4P28661 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sept4P28661 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sept4P28661 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sept4P28661 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sept4P28661 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sept4P28661 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sept4P28661 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sept4P28661 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sept4P28661 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sept4P28661 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sept4P28661 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Sept4P28661 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sept4P28661 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms