Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SSFA2P28290 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SSFA2P28290 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SSFA2P28290 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SSFA2P28290 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
SSFA2P28290 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SSFA2P28290 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SSFA2P28290 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SSFA2P28290 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SSFA2P28290 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SSFA2P28290 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SSFA2P28290 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SSFA2P28290 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SSFA2P28290 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SSFA2P28290 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SSFA2P28290 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SSFA2P28290 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SSFA2P28290 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SSFA2P28290 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SSFA2P28290 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SSFA2P28290 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
SSFA2P28290 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SSFA2P28290 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SSFA2P28290 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SSFA2P28290 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SSFA2P28290 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SSFA2P28290 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
SSFA2P28290 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SSFA2P28290 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SSFA2P28290 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SSFA2P28290 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SSFA2P28290 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SSFA2P28290 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SSFA2P28290 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SSFA2P28290 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SSFA2P28290 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SSFA2P28290 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SSFA2P28290 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SSFA2P28290 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SSFA2P28290 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SSFA2P28290 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
SSFA2P28290 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SSFA2P28290 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SSFA2P28290 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SSFA2P28290 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SSFA2P28290 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SSFA2P28290 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SSFA2P28290 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SSFA2P28290 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SSFA2P28290 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SSFA2P28290 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
SSFA2P28290 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SSFA2P28290 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SSFA2P28290 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SSFA2P28290 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SSFA2P28290 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
SSFA2P28290 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SSFA2P28290 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SSFA2P28290 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SSFA2P28290 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
SSFA2P28290 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SSFA2P28290 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SSFA2P28290 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SSFA2P28290 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SSFA2P28290 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SSFA2P28290 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SSFA2P28290 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SSFA2P28290 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SSFA2P28290 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SSFA2P28290 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SSFA2P28290 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SSFA2P28290 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SSFA2P28290 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SSFA2P28290 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SSFA2P28290 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
SSFA2P28290 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
SSFA2P28290 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
SSFA2P28290 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SSFA2P28290 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SSFA2P28290 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SSFA2P28290 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SSFA2P28290 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SSFA2P28290 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SSFA2P28290 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SSFA2P28290 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SSFA2P28290 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SSFA2P28290 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SSFA2P28290 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SSFA2P28290 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SSFA2P28290 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SSFA2P28290 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SSFA2P28290 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SSFA2P28290 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SSFA2P28290 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SSFA2P28290 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SSFA2P28290 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SSFA2P28290 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SSFA2P28290 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SSFA2P28290 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SSFA2P28290 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms