Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMB5P28074 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMB5P28074 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMB5P28074 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMB5P28074 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMB5P28074 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMB5P28074 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMB5P28074 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSMB5P28074 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMB5P28074 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMB5P28074 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMB5P28074 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMB5P28074 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMB5P28074 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMB5P28074 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMB5P28074 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMB5P28074 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMB5P28074 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMB5P28074 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMB5P28074 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMB5P28074 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMB5P28074 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMB5P28074 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMB5P28074 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMB5P28074 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMB5P28074 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMB5P28074 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMB5P28074 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMB5P28074 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMB5P28074 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMB5P28074 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMB5P28074 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMB5P28074 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMB5P28074 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMB5P28074 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMB5P28074 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMB5P28074 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMB5P28074 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMB5P28074 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMB5P28074 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMB5P28074 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMB5P28074 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMB5P28074 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMB5P28074 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMB5P28074 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMB5P28074 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMB5P28074 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMB5P28074 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMB5P28074 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMB5P28074 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMB5P28074 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms