Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LMO2P25791 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMO2P25791 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LMO2P25791 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMO2P25791 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMO2P25791 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMO2P25791 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMO2P25791 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMO2P25791 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMO2P25791 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMO2P25791 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMO2P25791 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMO2P25791 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMO2P25791 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LMO2P25791 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LMO2P25791 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMO2P25791 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMO2P25791 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMO2P25791 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMO2P25791 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMO2P25791 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMO2P25791 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMO2P25791 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMO2P25791 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMO2P25791 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMO2P25791 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMO2P25791 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMO2P25791 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMO2P25791 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMO2P25791 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMO2P25791 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMO2P25791 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMO2P25791 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMO2P25791 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LMO2P25791 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMO2P25791 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMO2P25791 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMO2P25791 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LMO2P25791 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMO2P25791 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LMO2P25791 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO2P25791 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO2P25791 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMO2P25791 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMO2P25791 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMO2P25791 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMO2P25791 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMO2P25791 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMO2P25791 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMO2P25791 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMO2P25791 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMO2P25791 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMO2P25791 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMO2P25791 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMO2P25791 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LMO2P25791 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMO2P25791 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMO2P25791 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMO2P25791 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMO2P25791 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMO2P25791 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMO2P25791 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMO2P25791 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMO2P25791 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMO2P25791 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMO2P25791 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMO2P25791 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMO2P25791 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMO2P25791 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMO2P25791 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMO2P25791 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMO2P25791 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMO2P25791 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMO2P25791 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMO2P25791 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMO2P25791 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMO2P25791 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMO2P25791 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMO2P25791 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMO2P25791 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMO2P25791 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMO2P25791 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMO2P25791 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMO2P25791 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMO2P25791 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMO2P25791 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMO2P25791 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMO2P25791 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMO2P25791 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMO2P25791 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMO2P25791 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMO2P25791 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMO2P25791 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMO2P25791 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LMO2P25791 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMO2P25791 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMO2P25791 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMO2P25791 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMO2P25791 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMO2P25791 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms