Protein–RNA interactions for Protein: P24863

CCNC, Cyclin-C, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNCP24863 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNCP24863 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNCP24863 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNCP24863 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNCP24863 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNCP24863 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNCP24863 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNCP24863 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNCP24863 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNCP24863 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNCP24863 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNCP24863 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNCP24863 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNCP24863 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNCP24863 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNCP24863 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNCP24863 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNCP24863 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNCP24863 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNCP24863 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNCP24863 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNCP24863 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNCP24863 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNCP24863 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNCP24863 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNCP24863 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNCP24863 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNCP24863 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNCP24863 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNCP24863 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNCP24863 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNCP24863 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNCP24863 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNCP24863 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNCP24863 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCNCP24863 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCNCP24863 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNCP24863 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNCP24863 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNCP24863 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNCP24863 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNCP24863 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNCP24863 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNCP24863 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNCP24863 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNCP24863 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNCP24863 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNCP24863 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNCP24863 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNCP24863 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNCP24863 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNCP24863 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNCP24863 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNCP24863 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNCP24863 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNCP24863 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNCP24863 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNCP24863 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNCP24863 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNCP24863 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNCP24863 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNCP24863 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNCP24863 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNCP24863 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNCP24863 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNCP24863 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNCP24863 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNCP24863 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNCP24863 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNCP24863 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNCP24863 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNCP24863 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNCP24863 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNCP24863 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNCP24863 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNCP24863 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNCP24863 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNCP24863 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNCP24863 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNCP24863 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNCP24863 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNCP24863 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNCP24863 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNCP24863 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNCP24863 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNCP24863 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNCP24863 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNCP24863 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNCP24863 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNCP24863 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCNCP24863 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCNCP24863 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCNCP24863 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCNCP24863 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNCP24863 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNCP24863 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNCP24863 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNCP24863 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNCP24863 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNCP24863 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms