Protein–RNA interactions for Protein: P24468

NR2F2, COUP transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F2P24468 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NR2F2P24468 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NR2F2P24468 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NR2F2P24468 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NR2F2P24468 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NR2F2P24468 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NR2F2P24468 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NR2F2P24468 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NR2F2P24468 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NR2F2P24468 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NR2F2P24468 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NR2F2P24468 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR2F2P24468 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR2F2P24468 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR2F2P24468 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR2F2P24468 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR2F2P24468 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR2F2P24468 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR2F2P24468 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR2F2P24468 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR2F2P24468 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR2F2P24468 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NR2F2P24468 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NR2F2P24468 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR2F2P24468 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR2F2P24468 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR2F2P24468 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR2F2P24468 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR2F2P24468 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR2F2P24468 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR2F2P24468 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NR2F2P24468 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NR2F2P24468 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NR2F2P24468 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
NR2F2P24468 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NR2F2P24468 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NR2F2P24468 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NR2F2P24468 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NR2F2P24468 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NR2F2P24468 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NR2F2P24468 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NR2F2P24468 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR2F2P24468 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR2F2P24468 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR2F2P24468 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR2F2P24468 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR2F2P24468 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR2F2P24468 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NR2F2P24468 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NR2F2P24468 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NR2F2P24468 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR2F2P24468 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR2F2P24468 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR2F2P24468 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR2F2P24468 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR2F2P24468 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NR2F2P24468 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR2F2P24468 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR2F2P24468 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR2F2P24468 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR2F2P24468 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR2F2P24468 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR2F2P24468 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR2F2P24468 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR2F2P24468 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR2F2P24468 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR2F2P24468 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR2F2P24468 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR2F2P24468 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR2F2P24468 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR2F2P24468 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR2F2P24468 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR2F2P24468 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR2F2P24468 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR2F2P24468 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR2F2P24468 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR2F2P24468 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR2F2P24468 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR2F2P24468 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NR2F2P24468 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR2F2P24468 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR2F2P24468 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR2F2P24468 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR2F2P24468 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR2F2P24468 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NR2F2P24468 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR2F2P24468 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR2F2P24468 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR2F2P24468 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR2F2P24468 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR2F2P24468 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR2F2P24468 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR2F2P24468 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR2F2P24468 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR2F2P24468 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR2F2P24468 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR2F2P24468 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR2F2P24468 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR2F2P24468 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR2F2P24468 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms