Protein–RNA interactions for Protein: P23475

Xrcc6, X-ray repair cross-complementing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc6P23475 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Xrcc6P23475 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xrcc6P23475 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Xrcc6P23475 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Xrcc6P23475 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Xrcc6P23475 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Xrcc6P23475 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Xrcc6P23475 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Xrcc6P23475 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Xrcc6P23475 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Xrcc6P23475 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Xrcc6P23475 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Xrcc6P23475 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Xrcc6P23475 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Xrcc6P23475 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Xrcc6P23475 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Xrcc6P23475 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Xrcc6P23475 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Xrcc6P23475 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Xrcc6P23475 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Xrcc6P23475 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Xrcc6P23475 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Xrcc6P23475 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Xrcc6P23475 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Xrcc6P23475 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Xrcc6P23475 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Xrcc6P23475 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Xrcc6P23475 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Xrcc6P23475 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Xrcc6P23475 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Xrcc6P23475 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Xrcc6P23475 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Xrcc6P23475 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Xrcc6P23475 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Xrcc6P23475 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Xrcc6P23475 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Xrcc6P23475 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Xrcc6P23475 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Xrcc6P23475 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Xrcc6P23475 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Xrcc6P23475 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Xrcc6P23475 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Xrcc6P23475 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Xrcc6P23475 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Xrcc6P23475 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Xrcc6P23475 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Xrcc6P23475 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Xrcc6P23475 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Xrcc6P23475 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Xrcc6P23475 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Xrcc6P23475 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Xrcc6P23475 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Xrcc6P23475 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Xrcc6P23475 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 215.6 ms