Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PparaP23204 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PparaP23204 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PparaP23204 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PparaP23204 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PparaP23204 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PparaP23204 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PparaP23204 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PparaP23204 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PparaP23204 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PparaP23204 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PparaP23204 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PparaP23204 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PparaP23204 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PparaP23204 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PparaP23204 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PparaP23204 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PparaP23204 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PparaP23204 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PparaP23204 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PparaP23204 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PparaP23204 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PparaP23204 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PparaP23204 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PparaP23204 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PparaP23204 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PparaP23204 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PparaP23204 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PparaP23204 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PparaP23204 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PparaP23204 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PparaP23204 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PparaP23204 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PparaP23204 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PparaP23204 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PparaP23204 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PparaP23204 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PparaP23204 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PparaP23204 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PparaP23204 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PparaP23204 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PparaP23204 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PparaP23204 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PparaP23204 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PparaP23204 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PparaP23204 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PparaP23204 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PparaP23204 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PparaP23204 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PparaP23204 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PparaP23204 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PparaP23204 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PparaP23204 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PparaP23204 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PparaP23204 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PparaP23204 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PparaP23204 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PparaP23204 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PparaP23204 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PparaP23204 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PparaP23204 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PparaP23204 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PparaP23204 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PparaP23204 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PparaP23204 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PparaP23204 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PparaP23204 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PparaP23204 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PparaP23204 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PparaP23204 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PparaP23204 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PparaP23204 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PparaP23204 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PparaP23204 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PparaP23204 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PparaP23204 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PparaP23204 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PparaP23204 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PparaP23204 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PparaP23204 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PparaP23204 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PparaP23204 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PparaP23204 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PparaP23204 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PparaP23204 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PparaP23204 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PparaP23204 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PparaP23204 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PparaP23204 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PparaP23204 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PparaP23204 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PparaP23204 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PparaP23204 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PparaP23204 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PparaP23204 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PparaP23204 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PparaP23204 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PparaP23204 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PparaP23204 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PparaP23204 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms