Protein–RNA interactions for Protein: P22894

MMP8, Neutrophil collagenase, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP8P22894 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP8P22894 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP8P22894 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP8P22894 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP8P22894 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP8P22894 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP8P22894 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP8P22894 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP8P22894 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP8P22894 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP8P22894 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP8P22894 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP8P22894 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP8P22894 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP8P22894 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP8P22894 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP8P22894 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP8P22894 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP8P22894 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP8P22894 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP8P22894 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP8P22894 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP8P22894 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP8P22894 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP8P22894 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP8P22894 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP8P22894 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP8P22894 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP8P22894 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MMP8P22894 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MMP8P22894 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP8P22894 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP8P22894 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP8P22894 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP8P22894 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP8P22894 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP8P22894 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP8P22894 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP8P22894 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP8P22894 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP8P22894 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP8P22894 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP8P22894 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP8P22894 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP8P22894 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP8P22894 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP8P22894 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP8P22894 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP8P22894 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP8P22894 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP8P22894 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP8P22894 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP8P22894 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP8P22894 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP8P22894 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP8P22894 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP8P22894 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP8P22894 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP8P22894 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP8P22894 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP8P22894 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP8P22894 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP8P22894 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP8P22894 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP8P22894 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP8P22894 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP8P22894 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP8P22894 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP8P22894 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MMP8P22894 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MMP8P22894 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
MMP8P22894 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP8P22894 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP8P22894 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP8P22894 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP8P22894 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP8P22894 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP8P22894 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP8P22894 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP8P22894 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP8P22894 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP8P22894 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP8P22894 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP8P22894 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP8P22894 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP8P22894 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP8P22894 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP8P22894 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP8P22894 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP8P22894 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP8P22894 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP8P22894 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP8P22894 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP8P22894 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP8P22894 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP8P22894 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP8P22894 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP8P22894 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP8P22894 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP8P22894 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 192.1 ms