Protein–RNA interactions for Protein: P22392

NME2, Nucleoside diphosphate kinase B, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2P22392 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME2P22392 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NME2P22392 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME2P22392 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME2P22392 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME2P22392 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME2P22392 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME2P22392 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME2P22392 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME2P22392 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME2P22392 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME2P22392 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME2P22392 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME2P22392 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME2P22392 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME2P22392 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME2P22392 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME2P22392 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NME2P22392 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME2P22392 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME2P22392 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME2P22392 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME2P22392 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME2P22392 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME2P22392 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME2P22392 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME2P22392 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME2P22392 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME2P22392 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME2P22392 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME2P22392 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME2P22392 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME2P22392 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME2P22392 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME2P22392 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME2P22392 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME2P22392 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NME2P22392 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME2P22392 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME2P22392 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME2P22392 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME2P22392 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME2P22392 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME2P22392 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME2P22392 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME2P22392 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME2P22392 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NME2P22392 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME2P22392 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME2P22392 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME2P22392 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME2P22392 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NME2P22392 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME2P22392 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME2P22392 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NME2P22392 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME2P22392 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NME2P22392 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME2P22392 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME2P22392 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME2P22392 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NME2P22392 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME2P22392 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME2P22392 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NME2P22392 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME2P22392 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME2P22392 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME2P22392 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME2P22392 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME2P22392 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME2P22392 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME2P22392 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME2P22392 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME2P22392 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME2P22392 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME2P22392 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME2P22392 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME2P22392 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME2P22392 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME2P22392 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NME2P22392 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME2P22392 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME2P22392 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME2P22392 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NME2P22392 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME2P22392 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME2P22392 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME2P22392 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME2P22392 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NME2P22392 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME2P22392 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME2P22392 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME2P22392 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME2P22392 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME2P22392 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME2P22392 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME2P22392 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME2P22392 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NME2P22392 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME2P22392 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms