Protein–RNA interactions for Protein: P22227

Zfp42, Zinc finger protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp42P22227 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp42P22227 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp42P22227 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp42P22227 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp42P22227 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp42P22227 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp42P22227 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp42P22227 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp42P22227 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp42P22227 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp42P22227 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp42P22227 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp42P22227 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp42P22227 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp42P22227 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp42P22227 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp42P22227 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp42P22227 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp42P22227 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp42P22227 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp42P22227 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp42P22227 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp42P22227 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp42P22227 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp42P22227 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp42P22227 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp42P22227 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp42P22227 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp42P22227 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp42P22227 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp42P22227 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp42P22227 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp42P22227 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp42P22227 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Zfp42P22227 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zfp42P22227 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp42P22227 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp42P22227 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp42P22227 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp42P22227 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp42P22227 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp42P22227 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp42P22227 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp42P22227 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp42P22227 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp42P22227 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp42P22227 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp42P22227 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp42P22227 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp42P22227 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp42P22227 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp42P22227 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms