Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cxcl9P18340 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cxcl9P18340 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cxcl9P18340 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cxcl9P18340 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cxcl9P18340 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cxcl9P18340 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cxcl9P18340 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cxcl9P18340 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cxcl9P18340 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cxcl9P18340 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cxcl9P18340 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cxcl9P18340 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cxcl9P18340 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cxcl9P18340 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cxcl9P18340 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Cxcl9P18340 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cxcl9P18340 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cxcl9P18340 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cxcl9P18340 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cxcl9P18340 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cxcl9P18340 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cxcl9P18340 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cxcl9P18340 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cxcl9P18340 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cxcl9P18340 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cxcl9P18340 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cxcl9P18340 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cxcl9P18340 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cxcl9P18340 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cxcl9P18340 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cxcl9P18340 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cxcl9P18340 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cxcl9P18340 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cxcl9P18340 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cxcl9P18340 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cxcl9P18340 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cxcl9P18340 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cxcl9P18340 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cxcl9P18340 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cxcl9P18340 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cxcl9P18340 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cxcl9P18340 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cxcl9P18340 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cxcl9P18340 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cxcl9P18340 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cxcl9P18340 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cxcl9P18340 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cxcl9P18340 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cxcl9P18340 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cxcl9P18340 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cxcl9P18340 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cxcl9P18340 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cxcl9P18340 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cxcl9P18340 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cxcl9P18340 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cxcl9P18340 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cxcl9P18340 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cxcl9P18340 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cxcl9P18340 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cxcl9P18340 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cxcl9P18340 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cxcl9P18340 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cxcl9P18340 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cxcl9P18340 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cxcl9P18340 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cxcl9P18340 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cxcl9P18340 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cxcl9P18340 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cxcl9P18340 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cxcl9P18340 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cxcl9P18340 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cxcl9P18340 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cxcl9P18340 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cxcl9P18340 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cxcl9P18340 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Cxcl9P18340 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cxcl9P18340 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cxcl9P18340 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cxcl9P18340 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cxcl9P18340 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cxcl9P18340 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cxcl9P18340 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cxcl9P18340 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cxcl9P18340 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cxcl9P18340 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cxcl9P18340 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cxcl9P18340 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cxcl9P18340 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cxcl9P18340 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cxcl9P18340 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cxcl9P18340 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cxcl9P18340 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cxcl9P18340 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cxcl9P18340 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cxcl9P18340 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cxcl9P18340 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cxcl9P18340 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cxcl9P18340 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cxcl9P18340 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 741 ms