Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtpraP18052 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtpraP18052 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtpraP18052 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtpraP18052 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PtpraP18052 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtpraP18052 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtpraP18052 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtpraP18052 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtpraP18052 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtpraP18052 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PtpraP18052 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PtpraP18052 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PtpraP18052 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PtpraP18052 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtpraP18052 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtpraP18052 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtpraP18052 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PtpraP18052 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtpraP18052 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtpraP18052 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtpraP18052 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtpraP18052 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtpraP18052 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtpraP18052 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtpraP18052 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtpraP18052 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtpraP18052 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtpraP18052 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtpraP18052 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtpraP18052 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtpraP18052 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtpraP18052 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtpraP18052 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtpraP18052 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtpraP18052 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtpraP18052 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtpraP18052 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtpraP18052 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtpraP18052 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtpraP18052 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtpraP18052 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtpraP18052 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtpraP18052 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtpraP18052 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtpraP18052 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtpraP18052 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtpraP18052 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtpraP18052 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtpraP18052 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtpraP18052 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtpraP18052 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PtpraP18052 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtpraP18052 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtpraP18052 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtpraP18052 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtpraP18052 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtpraP18052 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtpraP18052 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtpraP18052 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtpraP18052 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtpraP18052 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtpraP18052 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PtpraP18052 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtpraP18052 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtpraP18052 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtpraP18052 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtpraP18052 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtpraP18052 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtpraP18052 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtpraP18052 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtpraP18052 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtpraP18052 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtpraP18052 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtpraP18052 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PtpraP18052 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtpraP18052 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtpraP18052 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtpraP18052 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtpraP18052 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtpraP18052 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PtpraP18052 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PtpraP18052 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtpraP18052 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtpraP18052 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtpraP18052 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtpraP18052 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtpraP18052 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtpraP18052 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtpraP18052 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtpraP18052 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtpraP18052 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtpraP18052 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtpraP18052 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtpraP18052 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtpraP18052 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtpraP18052 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtpraP18052 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtpraP18052 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtpraP18052 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms