Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hmga1P17095 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hmga1P17095 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hmga1P17095 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hmga1P17095 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmga1P17095 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmga1P17095 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmga1P17095 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmga1P17095 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmga1P17095 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmga1P17095 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmga1P17095 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmga1P17095 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmga1P17095 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmga1P17095 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmga1P17095 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmga1P17095 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmga1P17095 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmga1P17095 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmga1P17095 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmga1P17095 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmga1P17095 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmga1P17095 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmga1P17095 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmga1P17095 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmga1P17095 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmga1P17095 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmga1P17095 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmga1P17095 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmga1P17095 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmga1P17095 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmga1P17095 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmga1P17095 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmga1P17095 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmga1P17095 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hmga1P17095 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmga1P17095 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmga1P17095 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmga1P17095 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmga1P17095 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmga1P17095 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmga1P17095 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmga1P17095 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmga1P17095 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hmga1P17095 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hmga1P17095 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hmga1P17095 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Hmga1P17095 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hmga1P17095 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Hmga1P17095 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hmga1P17095 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hmga1P17095 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hmga1P17095 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmga1P17095 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmga1P17095 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmga1P17095 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmga1P17095 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hmga1P17095 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Hmga1P17095 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hmga1P17095 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hmga1P17095 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmga1P17095 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmga1P17095 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmga1P17095 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmga1P17095 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmga1P17095 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmga1P17095 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmga1P17095 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hmga1P17095 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hmga1P17095 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hmga1P17095 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Hmga1P17095 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hmga1P17095 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hmga1P17095 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hmga1P17095 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hmga1P17095 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hmga1P17095 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hmga1P17095 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hmga1P17095 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hmga1P17095 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hmga1P17095 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hmga1P17095 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hmga1P17095 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hmga1P17095 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hmga1P17095 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hmga1P17095 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hmga1P17095 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hmga1P17095 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hmga1P17095 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hmga1P17095 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hmga1P17095 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.3 ms