Protein–RNA interactions for Protein: P16581

SELE, E-selectin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELEP16581 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SELEP16581 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SELEP16581 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SELEP16581 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SELEP16581 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SELEP16581 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SELEP16581 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SELEP16581 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SELEP16581 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SELEP16581 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SELEP16581 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SELEP16581 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SELEP16581 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SELEP16581 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SELEP16581 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SELEP16581 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SELEP16581 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SELEP16581 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SELEP16581 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SELEP16581 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SELEP16581 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SELEP16581 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SELEP16581 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SELEP16581 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SELEP16581 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SELEP16581 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SELEP16581 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SELEP16581 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SELEP16581 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SELEP16581 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SELEP16581 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SELEP16581 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SELEP16581 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SELEP16581 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SELEP16581 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SELEP16581 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SELEP16581 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SELEP16581 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SELEP16581 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SELEP16581 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SELEP16581 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SELEP16581 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SELEP16581 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SELEP16581 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SELEP16581 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SELEP16581 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SELEP16581 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SELEP16581 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SELEP16581 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SELEP16581 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SELEP16581 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SELEP16581 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SELEP16581 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SELEP16581 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SELEP16581 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SELEP16581 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SELEP16581 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SELEP16581 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SELEP16581 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SELEP16581 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SELEP16581 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SELEP16581 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SELEP16581 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SELEP16581 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SELEP16581 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SELEP16581 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SELEP16581 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SELEP16581 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SELEP16581 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SELEP16581 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SELEP16581 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SELEP16581 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SELEP16581 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SELEP16581 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SELEP16581 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SELEP16581 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SELEP16581 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SELEP16581 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SELEP16581 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SELEP16581 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SELEP16581 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SELEP16581 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SELEP16581 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SELEP16581 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SELEP16581 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SELEP16581 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SELEP16581 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SELEP16581 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SELEP16581 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SELEP16581 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SELEP16581 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SELEP16581 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SELEP16581 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SELEP16581 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SELEP16581 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SELEP16581 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SELEP16581 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SELEP16581 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SELEP16581 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SELEP16581 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms