Protein–RNA interactions for Protein: P13995

MTHFD2, Bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD2P13995 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MTHFD2P13995 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTHFD2P13995 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTHFD2P13995 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTHFD2P13995 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTHFD2P13995 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTHFD2P13995 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTHFD2P13995 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms