Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCG2P13521 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCG2P13521 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCG2P13521 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCG2P13521 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCG2P13521 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCG2P13521 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCG2P13521 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCG2P13521 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCG2P13521 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCG2P13521 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCG2P13521 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCG2P13521 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCG2P13521 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCG2P13521 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCG2P13521 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCG2P13521 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SCG2P13521 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SCG2P13521 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SCG2P13521 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SCG2P13521 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCG2P13521 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCG2P13521 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCG2P13521 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCG2P13521 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCG2P13521 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCG2P13521 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCG2P13521 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCG2P13521 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCG2P13521 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCG2P13521 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCG2P13521 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCG2P13521 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCG2P13521 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCG2P13521 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCG2P13521 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCG2P13521 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCG2P13521 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCG2P13521 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCG2P13521 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCG2P13521 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCG2P13521 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCG2P13521 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCG2P13521 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCG2P13521 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCG2P13521 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCG2P13521 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCG2P13521 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCG2P13521 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SCG2P13521 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCG2P13521 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCG2P13521 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCG2P13521 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCG2P13521 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCG2P13521 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SCG2P13521 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCG2P13521 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCG2P13521 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCG2P13521 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCG2P13521 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCG2P13521 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCG2P13521 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCG2P13521 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCG2P13521 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCG2P13521 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCG2P13521 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCG2P13521 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCG2P13521 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCG2P13521 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCG2P13521 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCG2P13521 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCG2P13521 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCG2P13521 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCG2P13521 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCG2P13521 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCG2P13521 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCG2P13521 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCG2P13521 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCG2P13521 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCG2P13521 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCG2P13521 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCG2P13521 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCG2P13521 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCG2P13521 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCG2P13521 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCG2P13521 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCG2P13521 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCG2P13521 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCG2P13521 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCG2P13521 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCG2P13521 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCG2P13521 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCG2P13521 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SCG2P13521 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SCG2P13521 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SCG2P13521 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCG2P13521 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCG2P13521 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCG2P13521 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCG2P13521 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms