Protein–RNA interactions for Protein: P12829

MYL4, Myosin light chain 4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL4P12829 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYL4P12829 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MYL4P12829 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MYL4P12829 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYL4P12829 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYL4P12829 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MYL4P12829 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYL4P12829 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MYL4P12829 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYL4P12829 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYL4P12829 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYL4P12829 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYL4P12829 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYL4P12829 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYL4P12829 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYL4P12829 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYL4P12829 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYL4P12829 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYL4P12829 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYL4P12829 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYL4P12829 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYL4P12829 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYL4P12829 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYL4P12829 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYL4P12829 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYL4P12829 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYL4P12829 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYL4P12829 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYL4P12829 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYL4P12829 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYL4P12829 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MYL4P12829 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MYL4P12829 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYL4P12829 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYL4P12829 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MYL4P12829 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MYL4P12829 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MYL4P12829 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MYL4P12829 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MYL4P12829 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MYL4P12829 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
MYL4P12829 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYL4P12829 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYL4P12829 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYL4P12829 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYL4P12829 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYL4P12829 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYL4P12829 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYL4P12829 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYL4P12829 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYL4P12829 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYL4P12829 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYL4P12829 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYL4P12829 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYL4P12829 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYL4P12829 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYL4P12829 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYL4P12829 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYL4P12829 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYL4P12829 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYL4P12829 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYL4P12829 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYL4P12829 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYL4P12829 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MYL4P12829 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MYL4P12829 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYL4P12829 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYL4P12829 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYL4P12829 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYL4P12829 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYL4P12829 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MYL4P12829 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MYL4P12829 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MYL4P12829 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYL4P12829 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYL4P12829 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYL4P12829 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYL4P12829 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYL4P12829 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYL4P12829 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYL4P12829 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYL4P12829 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYL4P12829 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYL4P12829 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYL4P12829 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYL4P12829 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYL4P12829 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYL4P12829 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYL4P12829 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYL4P12829 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYL4P12829 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYL4P12829 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYL4P12829 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYL4P12829 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYL4P12829 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYL4P12829 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYL4P12829 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYL4P12829 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYL4P12829 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYL4P12829 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms