Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrm1P12657 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrm1P12657 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrm1P12657 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrm1P12657 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrm1P12657 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrm1P12657 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrm1P12657 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrm1P12657 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chrm1P12657 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chrm1P12657 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chrm1P12657 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chrm1P12657 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chrm1P12657 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chrm1P12657 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chrm1P12657 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chrm1P12657 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chrm1P12657 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chrm1P12657 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chrm1P12657 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chrm1P12657 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chrm1P12657 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Chrm1P12657 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chrm1P12657 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chrm1P12657 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chrm1P12657 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chrm1P12657 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chrm1P12657 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chrm1P12657 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chrm1P12657 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chrm1P12657 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chrm1P12657 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chrm1P12657 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chrm1P12657 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chrm1P12657 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chrm1P12657 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chrm1P12657 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrm1P12657 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrm1P12657 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrm1P12657 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrm1P12657 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chrm1P12657 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chrm1P12657 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chrm1P12657 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chrm1P12657 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chrm1P12657 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chrm1P12657 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chrm1P12657 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chrm1P12657 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Chrm1P12657 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chrm1P12657 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.4 ms