Protein–RNA interactions for Protein: P11983

Tcp1, T-complex protein 1 subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcp1P11983 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcp1P11983 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcp1P11983 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcp1P11983 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcp1P11983 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcp1P11983 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcp1P11983 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcp1P11983 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcp1P11983 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcp1P11983 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcp1P11983 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcp1P11983 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcp1P11983 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcp1P11983 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcp1P11983 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tcp1P11983 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tcp1P11983 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcp1P11983 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcp1P11983 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcp1P11983 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcp1P11983 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcp1P11983 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcp1P11983 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcp1P11983 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcp1P11983 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcp1P11983 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcp1P11983 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcp1P11983 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcp1P11983 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcp1P11983 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcp1P11983 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcp1P11983 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcp1P11983 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcp1P11983 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcp1P11983 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcp1P11983 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcp1P11983 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcp1P11983 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcp1P11983 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcp1P11983 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcp1P11983 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcp1P11983 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcp1P11983 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcp1P11983 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcp1P11983 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcp1P11983 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcp1P11983 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcp1P11983 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcp1P11983 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcp1P11983 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcp1P11983 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcp1P11983 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcp1P11983 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcp1P11983 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcp1P11983 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcp1P11983 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcp1P11983 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcp1P11983 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcp1P11983 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcp1P11983 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcp1P11983 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcp1P11983 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcp1P11983 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcp1P11983 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcp1P11983 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcp1P11983 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcp1P11983 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcp1P11983 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcp1P11983 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcp1P11983 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcp1P11983 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcp1P11983 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcp1P11983 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcp1P11983 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcp1P11983 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcp1P11983 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcp1P11983 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcp1P11983 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcp1P11983 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcp1P11983 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcp1P11983 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcp1P11983 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcp1P11983 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcp1P11983 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcp1P11983 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcp1P11983 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcp1P11983 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcp1P11983 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcp1P11983 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcp1P11983 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcp1P11983 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcp1P11983 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcp1P11983 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcp1P11983 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tcp1P11983 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tcp1P11983 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcp1P11983 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcp1P11983 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcp1P11983 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcp1P11983 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms