Protein–RNA interactions for Protein: P11627

L1cam, Neural cell adhesion molecule L1, mousemouse

Predictions only

Length 1,260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1camP11627 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
L1camP11627 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
L1camP11627 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
L1camP11627 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
L1camP11627 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
L1camP11627 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
L1camP11627 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
L1camP11627 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
L1camP11627 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
L1camP11627 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
L1camP11627 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
L1camP11627 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
L1camP11627 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
L1camP11627 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
L1camP11627 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
L1camP11627 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
L1camP11627 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
L1camP11627 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
L1camP11627 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
L1camP11627 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
L1camP11627 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
L1camP11627 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
L1camP11627 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
L1camP11627 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
L1camP11627 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
L1camP11627 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
L1camP11627 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
L1camP11627 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
L1camP11627 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
L1camP11627 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
L1camP11627 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1camP11627 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1camP11627 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1camP11627 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1camP11627 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1camP11627 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1camP11627 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1camP11627 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1camP11627 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1camP11627 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1camP11627 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1camP11627 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
L1camP11627 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
L1camP11627 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
L1camP11627 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
L1camP11627 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
L1camP11627 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
L1camP11627 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
L1camP11627 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
L1camP11627 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
L1camP11627 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
L1camP11627 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
L1camP11627 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
L1camP11627 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
L1camP11627 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
L1camP11627 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
L1camP11627 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
L1camP11627 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
L1camP11627 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
L1camP11627 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
L1camP11627 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
L1camP11627 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
L1camP11627 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
L1camP11627 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
L1camP11627 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
L1camP11627 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
L1camP11627 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
L1camP11627 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
L1camP11627 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
L1camP11627 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
L1camP11627 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
L1camP11627 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
L1camP11627 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
L1camP11627 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
L1camP11627 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
L1camP11627 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
L1camP11627 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
L1camP11627 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
L1camP11627 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
L1camP11627 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
L1camP11627 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
L1camP11627 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
L1camP11627 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
L1camP11627 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
L1camP11627 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
L1camP11627 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
L1camP11627 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
L1camP11627 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
L1camP11627 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
L1camP11627 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
L1camP11627 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
L1camP11627 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
L1camP11627 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
L1camP11627 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
L1camP11627 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
L1camP11627 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
L1camP11627 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
L1camP11627 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
L1camP11627 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
L1camP11627 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms