Protein–RNA interactions for Protein: P11403

Fgf4, Fibroblast growth factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf4P11403 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf4P11403 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf4P11403 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fgf4P11403 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fgf4P11403 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fgf4P11403 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fgf4P11403 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fgf4P11403 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fgf4P11403 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fgf4P11403 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Fgf4P11403 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fgf4P11403 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fgf4P11403 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fgf4P11403 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fgf4P11403 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fgf4P11403 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fgf4P11403 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Fgf4P11403 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fgf4P11403 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fgf4P11403 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fgf4P11403 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fgf4P11403 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fgf4P11403 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fgf4P11403 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fgf4P11403 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fgf4P11403 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fgf4P11403 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fgf4P11403 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fgf4P11403 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fgf4P11403 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fgf4P11403 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fgf4P11403 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fgf4P11403 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms