Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLUP10909 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLUP10909 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLUP10909 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLUP10909 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLUP10909 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLUP10909 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLUP10909 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLUP10909 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLUP10909 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLUP10909 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLUP10909 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLUP10909 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLUP10909 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLUP10909 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLUP10909 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLUP10909 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLUP10909 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLUP10909 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLUP10909 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLUP10909 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CLUP10909 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLUP10909 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLUP10909 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLUP10909 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CLUP10909 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLUP10909 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLUP10909 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CLUP10909 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLUP10909 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLUP10909 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLUP10909 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLUP10909 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLUP10909 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLUP10909 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLUP10909 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLUP10909 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLUP10909 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLUP10909 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLUP10909 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLUP10909 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLUP10909 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLUP10909 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLUP10909 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CLUP10909 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLUP10909 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLUP10909 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLUP10909 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLUP10909 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLUP10909 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLUP10909 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLUP10909 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLUP10909 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLUP10909 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLUP10909 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLUP10909 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLUP10909 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLUP10909 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLUP10909 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLUP10909 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLUP10909 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLUP10909 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLUP10909 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLUP10909 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLUP10909 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLUP10909 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLUP10909 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLUP10909 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CLUP10909 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLUP10909 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLUP10909 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLUP10909 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLUP10909 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLUP10909 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLUP10909 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLUP10909 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLUP10909 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLUP10909 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLUP10909 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLUP10909 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLUP10909 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLUP10909 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLUP10909 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLUP10909 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLUP10909 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLUP10909 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLUP10909 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLUP10909 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLUP10909 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLUP10909 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLUP10909 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLUP10909 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLUP10909 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLUP10909 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLUP10909 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLUP10909 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLUP10909 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLUP10909 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CLUP10909 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLUP10909 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms