Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RARBP10826 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RARBP10826 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RARBP10826 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RARBP10826 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RARBP10826 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RARBP10826 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RARBP10826 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RARBP10826 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RARBP10826 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RARBP10826 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RARBP10826 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RARBP10826 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RARBP10826 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RARBP10826 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RARBP10826 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RARBP10826 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RARBP10826 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RARBP10826 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RARBP10826 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RARBP10826 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RARBP10826 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RARBP10826 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RARBP10826 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RARBP10826 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RARBP10826 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RARBP10826 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RARBP10826 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RARBP10826 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RARBP10826 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RARBP10826 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RARBP10826 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RARBP10826 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RARBP10826 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RARBP10826 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RARBP10826 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RARBP10826 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RARBP10826 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RARBP10826 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RARBP10826 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RARBP10826 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RARBP10826 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RARBP10826 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RARBP10826 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RARBP10826 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RARBP10826 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RARBP10826 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RARBP10826 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RARBP10826 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RARBP10826 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RARBP10826 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RARBP10826 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RARBP10826 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RARBP10826 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RARBP10826 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RARBP10826 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RARBP10826 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RARBP10826 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RARBP10826 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RARBP10826 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RARBP10826 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RARBP10826 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RARBP10826 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RARBP10826 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RARBP10826 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RARBP10826 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RARBP10826 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RARBP10826 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RARBP10826 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RARBP10826 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RARBP10826 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RARBP10826 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RARBP10826 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RARBP10826 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RARBP10826 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RARBP10826 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RARBP10826 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RARBP10826 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RARBP10826 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RARBP10826 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RARBP10826 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RARBP10826 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RARBP10826 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RARBP10826 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RARBP10826 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RARBP10826 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RARBP10826 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RARBP10826 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RARBP10826 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RARBP10826 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RARBP10826 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RARBP10826 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RARBP10826 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RARBP10826 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RARBP10826 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RARBP10826 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RARBP10826 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RARBP10826 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RARBP10826 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RARBP10826 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.8 ms