Protein–RNA interactions for Protein: P0CG32

ZCCHC18, Zinc finger CCHC domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC18P0CG32 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC18P0CG32 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC18P0CG32 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC18P0CG32 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC18P0CG32 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC18P0CG32 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC18P0CG32 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC18P0CG32 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC18P0CG32 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC18P0CG32 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC18P0CG32 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC18P0CG32 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZCCHC18P0CG32 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZCCHC18P0CG32 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZCCHC18P0CG32 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZCCHC18P0CG32 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZCCHC18P0CG32 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZCCHC18P0CG32 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZCCHC18P0CG32 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC18P0CG32 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC18P0CG32 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC18P0CG32 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC18P0CG32 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC18P0CG32 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC18P0CG32 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC18P0CG32 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC18P0CG32 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC18P0CG32 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC18P0CG32 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC18P0CG32 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZCCHC18P0CG32 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZCCHC18P0CG32 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZCCHC18P0CG32 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZCCHC18P0CG32 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZCCHC18P0CG32 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZCCHC18P0CG32 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZCCHC18P0CG32 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZCCHC18P0CG32 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZCCHC18P0CG32 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZCCHC18P0CG32 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC18P0CG32 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC18P0CG32 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC18P0CG32 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC18P0CG32 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC18P0CG32 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC18P0CG32 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZCCHC18P0CG32 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms