Protein–RNA interactions for Protein: P0CB42

Alkbh1, Nucleic acid dioxygenase ALKBH1, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh1P0CB42 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Alkbh1P0CB42 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Alkbh1P0CB42 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Alkbh1P0CB42 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Alkbh1P0CB42 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Alkbh1P0CB42 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Alkbh1P0CB42 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Alkbh1P0CB42 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Alkbh1P0CB42 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Alkbh1P0CB42 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Alkbh1P0CB42 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Alkbh1P0CB42 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Alkbh1P0CB42 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Alkbh1P0CB42 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Alkbh1P0CB42 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Alkbh1P0CB42 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Alkbh1P0CB42 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Alkbh1P0CB42 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Alkbh1P0CB42 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Alkbh1P0CB42 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Alkbh1P0CB42 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Alkbh1P0CB42 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Alkbh1P0CB42 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Alkbh1P0CB42 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Alkbh1P0CB42 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Alkbh1P0CB42 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Alkbh1P0CB42 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Alkbh1P0CB42 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Alkbh1P0CB42 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Alkbh1P0CB42 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Alkbh1P0CB42 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Alkbh1P0CB42 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Alkbh1P0CB42 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Alkbh1P0CB42 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Alkbh1P0CB42 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Alkbh1P0CB42 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Alkbh1P0CB42 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Alkbh1P0CB42 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Alkbh1P0CB42 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Alkbh1P0CB42 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Alkbh1P0CB42 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Alkbh1P0CB42 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Alkbh1P0CB42 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Alkbh1P0CB42 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Alkbh1P0CB42 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Alkbh1P0CB42 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Alkbh1P0CB42 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Alkbh1P0CB42 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Alkbh1P0CB42 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Alkbh1P0CB42 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Alkbh1P0CB42 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Alkbh1P0CB42 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Alkbh1P0CB42 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Alkbh1P0CB42 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alkbh1P0CB42 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alkbh1P0CB42 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alkbh1P0CB42 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Alkbh1P0CB42 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alkbh1P0CB42 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alkbh1P0CB42 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alkbh1P0CB42 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alkbh1P0CB42 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alkbh1P0CB42 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alkbh1P0CB42 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Alkbh1P0CB42 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Alkbh1P0CB42 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Alkbh1P0CB42 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Alkbh1P0CB42 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Alkbh1P0CB42 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Alkbh1P0CB42 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms