Protein–RNA interactions for Protein: P09632

Hoxb8, Homeobox protein Hox-B8, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb8P09632 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxb8P09632 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxb8P09632 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxb8P09632 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxb8P09632 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxb8P09632 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxb8P09632 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxb8P09632 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxb8P09632 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxb8P09632 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxb8P09632 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxb8P09632 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxb8P09632 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxb8P09632 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxb8P09632 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxb8P09632 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxb8P09632 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxb8P09632 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxb8P09632 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxb8P09632 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxb8P09632 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxb8P09632 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxb8P09632 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxb8P09632 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxb8P09632 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxb8P09632 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxb8P09632 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxb8P09632 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxb8P09632 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxb8P09632 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxb8P09632 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxb8P09632 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxb8P09632 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxb8P09632 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxb8P09632 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Hoxb8P09632 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxb8P09632 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxb8P09632 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxb8P09632 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxb8P09632 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxb8P09632 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxb8P09632 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxb8P09632 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxb8P09632 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxb8P09632 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxb8P09632 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxb8P09632 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxb8P09632 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxb8P09632 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxb8P09632 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxb8P09632 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxb8P09632 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxb8P09632 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxb8P09632 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxb8P09632 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxb8P09632 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxb8P09632 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxb8P09632 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxb8P09632 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxb8P09632 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxb8P09632 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxb8P09632 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxb8P09632 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxb8P09632 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxb8P09632 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxb8P09632 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxb8P09632 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxb8P09632 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxb8P09632 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxb8P09632 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxb8P09632 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxb8P09632 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxb8P09632 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxb8P09632 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxb8P09632 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxb8P09632 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hoxb8P09632 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms