Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxb3P09026 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxb3P09026 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxb3P09026 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxb3P09026 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxb3P09026 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxb3P09026 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxb3P09026 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb3P09026 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb3P09026 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb3P09026 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb3P09026 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb3P09026 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb3P09026 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb3P09026 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb3P09026 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb3P09026 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb3P09026 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb3P09026 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb3P09026 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxb3P09026 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hoxb3P09026 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxb3P09026 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hoxb3P09026 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxb3P09026 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hoxb3P09026 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxb3P09026 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxb3P09026 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxb3P09026 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb3P09026 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb3P09026 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb3P09026 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb3P09026 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb3P09026 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb3P09026 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb3P09026 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb3P09026 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb3P09026 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb3P09026 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb3P09026 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb3P09026 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxb3P09026 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxb3P09026 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxb3P09026 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxb3P09026 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxb3P09026 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxb3P09026 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxb3P09026 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxb3P09026 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Hoxb3P09026 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxb3P09026 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxb3P09026 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxb3P09026 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxb3P09026 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxb3P09026 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxb3P09026 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxb3P09026 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxb3P09026 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxb3P09026 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxb3P09026 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxb3P09026 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxb3P09026 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxb3P09026 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxb3P09026 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxb3P09026 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxb3P09026 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxb3P09026 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxb3P09026 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxb3P09026 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxb3P09026 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxb3P09026 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxb3P09026 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxb3P09026 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxb3P09026 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxb3P09026 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxb3P09026 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxb3P09026 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxb3P09026 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxb3P09026 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxb3P09026 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxb3P09026 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxb3P09026 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxb3P09026 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxb3P09026 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxb3P09026 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxb3P09026 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxb3P09026 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxb3P09026 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxb3P09026 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxb3P09026 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxb3P09026 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxb3P09026 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms