Protein–RNA interactions for Protein: P08247

SYP, Synaptophysin, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPP08247 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SYPP08247 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYPP08247 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYPP08247 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYPP08247 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYPP08247 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYPP08247 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYPP08247 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYPP08247 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYPP08247 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYPP08247 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYPP08247 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYPP08247 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SYPP08247 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYPP08247 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYPP08247 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYPP08247 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYPP08247 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYPP08247 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYPP08247 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYPP08247 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYPP08247 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYPP08247 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYPP08247 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYPP08247 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYPP08247 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYPP08247 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYPP08247 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYPP08247 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYPP08247 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SYPP08247 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYPP08247 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYPP08247 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYPP08247 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYPP08247 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYPP08247 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYPP08247 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYPP08247 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYPP08247 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYPP08247 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SYPP08247 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYPP08247 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYPP08247 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYPP08247 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYPP08247 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYPP08247 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYPP08247 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYPP08247 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYPP08247 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYPP08247 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYPP08247 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYPP08247 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYPP08247 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYPP08247 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SYPP08247 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYPP08247 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SYPP08247 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYPP08247 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYPP08247 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYPP08247 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYPP08247 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYPP08247 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYPP08247 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYPP08247 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYPP08247 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYPP08247 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYPP08247 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYPP08247 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SYPP08247 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYPP08247 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYPP08247 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYPP08247 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYPP08247 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYPP08247 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SYPP08247 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYPP08247 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYPP08247 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYPP08247 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYPP08247 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYPP08247 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYPP08247 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYPP08247 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYPP08247 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYPP08247 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYPP08247 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYPP08247 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYPP08247 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYPP08247 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SYPP08247 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYPP08247 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYPP08247 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYPP08247 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYPP08247 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYPP08247 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYPP08247 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYPP08247 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYPP08247 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYPP08247 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYPP08247 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYPP08247 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.8 ms