Protein–RNA interactions for Protein: P08195

SLC3A2, 4F2 cell-surface antigen heavy chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A2P08195 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC3A2P08195 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC3A2P08195 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC3A2P08195 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC3A2P08195 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC3A2P08195 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC3A2P08195 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC3A2P08195 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC3A2P08195 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC3A2P08195 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC3A2P08195 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC3A2P08195 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC3A2P08195 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC3A2P08195 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC3A2P08195 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC3A2P08195 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC3A2P08195 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC3A2P08195 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC3A2P08195 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC3A2P08195 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC3A2P08195 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC3A2P08195 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC3A2P08195 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC3A2P08195 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC3A2P08195 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC3A2P08195 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC3A2P08195 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC3A2P08195 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC3A2P08195 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC3A2P08195 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC3A2P08195 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC3A2P08195 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC3A2P08195 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC3A2P08195 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC3A2P08195 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC3A2P08195 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC3A2P08195 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC3A2P08195 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC3A2P08195 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC3A2P08195 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC3A2P08195 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC3A2P08195 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC3A2P08195 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC3A2P08195 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC3A2P08195 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC3A2P08195 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC3A2P08195 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC3A2P08195 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC3A2P08195 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC3A2P08195 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC3A2P08195 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC3A2P08195 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC3A2P08195 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC3A2P08195 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC3A2P08195 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC3A2P08195 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC3A2P08195 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC3A2P08195 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC3A2P08195 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC3A2P08195 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC3A2P08195 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC3A2P08195 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC3A2P08195 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC3A2P08195 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC3A2P08195 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC3A2P08195 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC3A2P08195 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC3A2P08195 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC3A2P08195 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC3A2P08195 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC3A2P08195 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC3A2P08195 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC3A2P08195 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC3A2P08195 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC3A2P08195 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC3A2P08195 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC3A2P08195 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC3A2P08195 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC3A2P08195 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC3A2P08195 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC3A2P08195 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC3A2P08195 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC3A2P08195 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC3A2P08195 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC3A2P08195 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC3A2P08195 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC3A2P08195 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC3A2P08195 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC3A2P08195 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC3A2P08195 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC3A2P08195 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC3A2P08195 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC3A2P08195 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC3A2P08195 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC3A2P08195 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC3A2P08195 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC3A2P08195 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC3A2P08195 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC3A2P08195 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC3A2P08195 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms