Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TPM2P07951 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TPM2P07951 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TPM2P07951 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TPM2P07951 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TPM2P07951 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TPM2P07951 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TPM2P07951 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TPM2P07951 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TPM2P07951 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TPM2P07951 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TPM2P07951 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TPM2P07951 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TPM2P07951 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TPM2P07951 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TPM2P07951 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TPM2P07951 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TPM2P07951 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TPM2P07951 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TPM2P07951 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TPM2P07951 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TPM2P07951 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TPM2P07951 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TPM2P07951 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TPM2P07951 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TPM2P07951 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TPM2P07951 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TPM2P07951 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TPM2P07951 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TPM2P07951 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TPM2P07951 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TPM2P07951 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TPM2P07951 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPM2P07951 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPM2P07951 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPM2P07951 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPM2P07951 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPM2P07951 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPM2P07951 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPM2P07951 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TPM2P07951 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TPM2P07951 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TPM2P07951 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TPM2P07951 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TPM2P07951 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TPM2P07951 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TPM2P07951 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TPM2P07951 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TPM2P07951 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TPM2P07951 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TPM2P07951 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TPM2P07951 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TPM2P07951 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TPM2P07951 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TPM2P07951 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TPM2P07951 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TPM2P07951 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TPM2P07951 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TPM2P07951 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TPM2P07951 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TPM2P07951 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TPM2P07951 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TPM2P07951 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TPM2P07951 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TPM2P07951 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TPM2P07951 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TPM2P07951 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TPM2P07951 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TPM2P07951 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TPM2P07951 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TPM2P07951 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TPM2P07951 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TPM2P07951 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TPM2P07951 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TPM2P07951 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TPM2P07951 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TPM2P07951 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TPM2P07951 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TPM2P07951 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TPM2P07951 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TPM2P07951 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TPM2P07951 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TPM2P07951 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TPM2P07951 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TPM2P07951 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TPM2P07951 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TPM2P07951 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TPM2P07951 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TPM2P07951 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TPM2P07951 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TPM2P07951 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TPM2P07951 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TPM2P07951 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TPM2P07951 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TPM2P07951 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TPM2P07951 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TPM2P07951 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TPM2P07951 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TPM2P07951 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TPM2P07951 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms