Protein–RNA interactions for Protein: P05771

PRKCB, Protein kinase C beta type, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCBP05771 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKCBP05771 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKCBP05771 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKCBP05771 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKCBP05771 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKCBP05771 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKCBP05771 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKCBP05771 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKCBP05771 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKCBP05771 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKCBP05771 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKCBP05771 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKCBP05771 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKCBP05771 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKCBP05771 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKCBP05771 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKCBP05771 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRKCBP05771 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRKCBP05771 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKCBP05771 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKCBP05771 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKCBP05771 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKCBP05771 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKCBP05771 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKCBP05771 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKCBP05771 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKCBP05771 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKCBP05771 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKCBP05771 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKCBP05771 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKCBP05771 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKCBP05771 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKCBP05771 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCBP05771 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCBP05771 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCBP05771 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCBP05771 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCBP05771 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKCBP05771 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKCBP05771 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKCBP05771 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKCBP05771 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKCBP05771 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKCBP05771 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKCBP05771 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKCBP05771 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKCBP05771 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKCBP05771 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKCBP05771 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKCBP05771 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKCBP05771 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKCBP05771 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKCBP05771 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKCBP05771 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKCBP05771 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKCBP05771 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKCBP05771 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKCBP05771 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCBP05771 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCBP05771 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKCBP05771 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKCBP05771 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKCBP05771 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKCBP05771 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKCBP05771 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKCBP05771 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKCBP05771 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKCBP05771 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKCBP05771 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKCBP05771 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKCBP05771 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKCBP05771 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKCBP05771 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKCBP05771 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKCBP05771 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKCBP05771 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKCBP05771 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKCBP05771 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKCBP05771 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKCBP05771 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKCBP05771 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKCBP05771 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKCBP05771 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKCBP05771 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKCBP05771 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKCBP05771 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKCBP05771 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKCBP05771 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKCBP05771 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKCBP05771 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKCBP05771 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKCBP05771 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKCBP05771 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKCBP05771 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKCBP05771 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKCBP05771 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKCBP05771 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKCBP05771 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKCBP05771 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKCBP05771 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms