Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APODP05090 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APODP05090 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APODP05090 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APODP05090 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APODP05090 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APODP05090 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
APODP05090 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APODP05090 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APODP05090 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APODP05090 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APODP05090 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APODP05090 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APODP05090 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APODP05090 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APODP05090 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APODP05090 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APODP05090 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APODP05090 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APODP05090 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APODP05090 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APODP05090 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APODP05090 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APODP05090 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
APODP05090 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APODP05090 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APODP05090 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APODP05090 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APODP05090 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APODP05090 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APODP05090 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APODP05090 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
APODP05090 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
APODP05090 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
APODP05090 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
APODP05090 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APODP05090 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APODP05090 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APODP05090 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APODP05090 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APODP05090 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APODP05090 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APODP05090 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APODP05090 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APODP05090 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APODP05090 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APODP05090 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APODP05090 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APODP05090 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APODP05090 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APODP05090 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APODP05090 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APODP05090 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APODP05090 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APODP05090 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APODP05090 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APODP05090 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APODP05090 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APODP05090 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APODP05090 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APODP05090 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APODP05090 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APODP05090 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APODP05090 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APODP05090 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APODP05090 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APODP05090 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
APODP05090 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APODP05090 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APODP05090 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
APODP05090 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APODP05090 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APODP05090 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APODP05090 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
APODP05090 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APODP05090 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APODP05090 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APODP05090 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
APODP05090 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APODP05090 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APODP05090 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APODP05090 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APODP05090 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APODP05090 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APODP05090 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APODP05090 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APODP05090 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APODP05090 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24■■□□□ 1.43
APODP05090 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APODP05090 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APODP05090 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APODP05090 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APODP05090 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
APODP05090 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APODP05090 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APODP05090 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APODP05090 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APODP05090 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APODP05090 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APODP05090 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms