Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Lamc1P02468 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Lamc1P02468 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Lamc1P02468 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Lamc1P02468 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Lamc1P02468 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Lamc1P02468 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Lamc1P02468 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Lamc1P02468 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Lamc1P02468 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Lamc1P02468 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Lamc1P02468 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Lamc1P02468 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Lamc1P02468 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms