Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Lamc1P02468 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Lamc1P02468 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Lamc1P02468 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Lamc1P02468 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Lamc1P02468 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Lamc1P02468 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Lamc1P02468 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Lamc1P02468 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Lamc1P02468 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Lamc1P02468 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Lamc1P02468 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Lamc1P02468 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Lamc1P02468 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Lamc1P02468 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Lamc1P02468 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Lamc1P02468 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms