Protein–RNA interactions for Protein: P01738

T-cell receptor alpha chain V region PHDS58, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01738 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01738 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01738 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01738 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01738 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01738 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01738 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01738 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01738 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01738 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01738 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01738 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01738 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
P01738 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01738 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01738 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01738 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01738 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01738 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01738 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01738 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01738 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01738 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01738 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01738 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01738 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01738 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01738 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01738 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01738 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01738 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01738 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01738 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01738 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01738 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01738 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01738 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01738 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01738 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01738 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01738 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01738 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01738 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01738 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01738 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01738 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01738 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01738 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01738 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01738 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01738 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01738 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01738 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01738 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01738 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01738 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01738 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01738 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01738 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01738 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01738 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01738 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01738 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01738 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01738 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01738 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01738 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01738 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01738 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01738 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01738 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01738 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01738 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01738 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01738 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01738 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01738 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01738 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01738 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01738 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01738 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01738 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01738 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01738 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01738 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
P01738 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01738 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01738 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01738 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01738 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01738 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01738 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01738 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01738 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01738 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01738 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01738 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01738 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01738 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01738 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms