Protein–RNA interactions for Protein: P01725

Ig lambda-1 chain V region S178, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01725 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01725 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01725 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01725 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01725 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01725 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01725 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01725 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01725 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01725 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01725 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01725 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01725 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01725 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01725 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01725 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01725 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01725 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01725 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01725 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01725 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01725 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01725 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01725 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01725 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01725 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
P01725 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01725 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01725 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01725 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01725 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01725 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01725 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01725 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01725 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01725 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01725 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01725 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
P01725 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
P01725 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
P01725 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01725 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01725 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01725 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01725 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01725 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01725 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01725 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01725 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01725 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01725 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01725 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
P01725 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01725 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01725 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01725 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01725 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01725 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01725 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01725 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01725 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01725 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01725 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01725 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
P01725 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01725 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01725 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01725 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01725 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
P01725 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01725 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01725 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01725 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01725 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01725 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01725 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01725 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01725 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01725 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01725 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01725 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01725 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01725 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01725 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01725 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01725 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01725 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01725 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01725 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01725 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01725 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
P01725 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01725 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01725 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01725 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01725 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01725 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01725 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01725 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01725 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms