Protein–RNA interactions for Protein: P01653

Ig kappa chain V-V region W3082, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01653 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01653 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01653 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01653 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01653 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01653 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01653 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01653 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01653 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01653 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
P01653 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01653 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01653 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01653 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01653 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01653 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01653 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01653 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01653 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01653 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01653 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01653 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01653 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01653 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01653 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01653 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01653 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01653 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01653 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01653 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01653 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
P01653 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01653 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01653 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01653 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
P01653 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
P01653 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
P01653 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
P01653 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
P01653 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
P01653 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
P01653 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
P01653 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
P01653 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01653 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01653 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01653 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01653 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01653 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01653 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01653 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01653 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01653 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01653 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01653 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01653 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01653 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01653 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01653 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01653 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01653 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01653 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01653 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01653 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01653 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
P01653 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01653 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01653 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01653 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01653 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01653 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01653 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01653 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01653 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01653 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01653 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01653 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01653 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01653 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01653 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
P01653 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
P01653 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
P01653 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
P01653 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01653 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01653 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01653 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01653 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01653 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01653 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01653 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
P01653 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01653 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
P01653 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01653 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01653 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01653 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01653 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01653 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01653 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.5 ms