Protein–RNA interactions for Protein: P01029

C4b, Complement C4-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4bP01029 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C4bP01029 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C4bP01029 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C4bP01029 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C4bP01029 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
C4bP01029 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C4bP01029 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
C4bP01029 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C4bP01029 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C4bP01029 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C4bP01029 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C4bP01029 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C4bP01029 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
C4bP01029 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C4bP01029 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
C4bP01029 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C4bP01029 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C4bP01029 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C4bP01029 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C4bP01029 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C4bP01029 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C4bP01029 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C4bP01029 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C4bP01029 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C4bP01029 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C4bP01029 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C4bP01029 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C4bP01029 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C4bP01029 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C4bP01029 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C4bP01029 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
C4bP01029 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C4bP01029 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C4bP01029 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C4bP01029 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C4bP01029 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C4bP01029 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C4bP01029 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
C4bP01029 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
C4bP01029 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
C4bP01029 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
C4bP01029 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
C4bP01029 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C4bP01029 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C4bP01029 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C4bP01029 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C4bP01029 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
C4bP01029 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C4bP01029 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C4bP01029 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C4bP01029 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C4bP01029 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C4bP01029 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C4bP01029 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C4bP01029 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C4bP01029 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C4bP01029 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C4bP01029 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C4bP01029 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C4bP01029 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C4bP01029 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C4bP01029 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C4bP01029 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C4bP01029 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C4bP01029 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C4bP01029 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C4bP01029 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C4bP01029 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C4bP01029 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C4bP01029 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C4bP01029 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C4bP01029 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
C4bP01029 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
C4bP01029 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C4bP01029 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C4bP01029 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C4bP01029 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
C4bP01029 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C4bP01029 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C4bP01029 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
C4bP01029 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C4bP01029 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
C4bP01029 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C4bP01029 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C4bP01029 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C4bP01029 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C4bP01029 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C4bP01029 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C4bP01029 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
C4bP01029 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
C4bP01029 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C4bP01029 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C4bP01029 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
C4bP01029 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C4bP01029 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C4bP01029 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C4bP01029 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C4bP01029 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C4bP01029 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C4bP01029 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 175.5 ms