Protein–RNA interactions for Protein: P00520

Abl1, Tyrosine-protein kinase ABL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abl1P00520 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abl1P00520 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abl1P00520 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abl1P00520 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abl1P00520 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abl1P00520 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abl1P00520 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abl1P00520 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abl1P00520 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abl1P00520 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abl1P00520 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abl1P00520 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abl1P00520 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Abl1P00520 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Abl1P00520 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Abl1P00520 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Abl1P00520 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Abl1P00520 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Abl1P00520 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Abl1P00520 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abl1P00520 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abl1P00520 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Abl1P00520 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abl1P00520 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abl1P00520 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abl1P00520 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Abl1P00520 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Abl1P00520 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Abl1P00520 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Abl1P00520 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Abl1P00520 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Abl1P00520 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Abl1P00520 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Abl1P00520 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Abl1P00520 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Abl1P00520 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Abl1P00520 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Abl1P00520 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Abl1P00520 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Abl1P00520 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Abl1P00520 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Abl1P00520 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Abl1P00520 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Abl1P00520 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Abl1P00520 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Abl1P00520 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Abl1P00520 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Abl1P00520 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Abl1P00520 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Abl1P00520 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Abl1P00520 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Abl1P00520 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Abl1P00520 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Abl1P00520 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Abl1P00520 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Abl1P00520 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Abl1P00520 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Abl1P00520 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Abl1P00520 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Abl1P00520 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Abl1P00520 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Abl1P00520 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Abl1P00520 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Abl1P00520 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Abl1P00520 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Abl1P00520 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Abl1P00520 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Abl1P00520 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Abl1P00520 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Abl1P00520 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Abl1P00520 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Abl1P00520 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Abl1P00520 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Abl1P00520 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Abl1P00520 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Abl1P00520 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Abl1P00520 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Abl1P00520 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Abl1P00520 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Abl1P00520 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Abl1P00520 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Abl1P00520 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Abl1P00520 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Abl1P00520 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Abl1P00520 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Abl1P00520 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Abl1P00520 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Abl1P00520 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Abl1P00520 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Abl1P00520 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Abl1P00520 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Abl1P00520 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Abl1P00520 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Abl1P00520 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Abl1P00520 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Abl1P00520 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Abl1P00520 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Abl1P00520 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Abl1P00520 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Abl1P00520 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1429.8 ms