Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZBED1O96006 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZBED1O96006 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZBED1O96006 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZBED1O96006 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ZBED1O96006 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZBED1O96006 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZBED1O96006 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZBED1O96006 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ZBED1O96006 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ZBED1O96006 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZBED1O96006 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZBED1O96006 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZBED1O96006 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZBED1O96006 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED1O96006 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED1O96006 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED1O96006 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED1O96006 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED1O96006 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED1O96006 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZBED1O96006 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZBED1O96006 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZBED1O96006 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZBED1O96006 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZBED1O96006 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ZBED1O96006 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZBED1O96006 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZBED1O96006 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZBED1O96006 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZBED1O96006 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZBED1O96006 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZBED1O96006 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZBED1O96006 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZBED1O96006 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZBED1O96006 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZBED1O96006 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZBED1O96006 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZBED1O96006 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZBED1O96006 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZBED1O96006 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZBED1O96006 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZBED1O96006 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZBED1O96006 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZBED1O96006 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZBED1O96006 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZBED1O96006 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZBED1O96006 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ZBED1O96006 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZBED1O96006 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED1O96006 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED1O96006 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED1O96006 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED1O96006 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED1O96006 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED1O96006 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED1O96006 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED1O96006 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED1O96006 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED1O96006 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ZBED1O96006 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZBED1O96006 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZBED1O96006 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZBED1O96006 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZBED1O96006 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ZBED1O96006 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZBED1O96006 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZBED1O96006 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZBED1O96006 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZBED1O96006 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZBED1O96006 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZBED1O96006 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZBED1O96006 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZBED1O96006 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZBED1O96006 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZBED1O96006 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZBED1O96006 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZBED1O96006 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZBED1O96006 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZBED1O96006 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZBED1O96006 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZBED1O96006 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZBED1O96006 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ZBED1O96006 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZBED1O96006 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZBED1O96006 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ZBED1O96006 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZBED1O96006 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZBED1O96006 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZBED1O96006 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZBED1O96006 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZBED1O96006 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZBED1O96006 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZBED1O96006 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZBED1O96006 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBED1O96006 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBED1O96006 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBED1O96006 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBED1O96006 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBED1O96006 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
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