Protein–RNA interactions for Protein: O95755

RAB36, Ras-related protein Rab-36, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB36O95755 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB36O95755 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB36O95755 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB36O95755 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB36O95755 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB36O95755 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB36O95755 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB36O95755 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB36O95755 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB36O95755 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB36O95755 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB36O95755 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB36O95755 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB36O95755 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB36O95755 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB36O95755 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB36O95755 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB36O95755 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB36O95755 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB36O95755 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB36O95755 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB36O95755 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB36O95755 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB36O95755 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB36O95755 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB36O95755 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB36O95755 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB36O95755 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB36O95755 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB36O95755 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB36O95755 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB36O95755 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB36O95755 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB36O95755 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB36O95755 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB36O95755 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB36O95755 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB36O95755 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB36O95755 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB36O95755 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB36O95755 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB36O95755 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB36O95755 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB36O95755 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB36O95755 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB36O95755 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB36O95755 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB36O95755 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB36O95755 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB36O95755 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB36O95755 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB36O95755 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB36O95755 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB36O95755 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB36O95755 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB36O95755 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB36O95755 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB36O95755 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB36O95755 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB36O95755 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB36O95755 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB36O95755 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB36O95755 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB36O95755 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB36O95755 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB36O95755 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB36O95755 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB36O95755 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB36O95755 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB36O95755 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB36O95755 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB36O95755 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB36O95755 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB36O95755 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB36O95755 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB36O95755 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB36O95755 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB36O95755 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB36O95755 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB36O95755 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB36O95755 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB36O95755 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB36O95755 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB36O95755 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB36O95755 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB36O95755 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB36O95755 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB36O95755 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB36O95755 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB36O95755 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB36O95755 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB36O95755 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB36O95755 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB36O95755 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB36O95755 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB36O95755 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB36O95755 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
RAB36O95755 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB36O95755 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB36O95755 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms