Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAPINO95295 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAPINO95295 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAPINO95295 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAPINO95295 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAPINO95295 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAPINO95295 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAPINO95295 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAPINO95295 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAPINO95295 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNAPINO95295 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNAPINO95295 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNAPINO95295 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNAPINO95295 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SNAPINO95295 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SNAPINO95295 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
SNAPINO95295 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNAPINO95295 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNAPINO95295 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNAPINO95295 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNAPINO95295 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNAPINO95295 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNAPINO95295 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNAPINO95295 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNAPINO95295 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNAPINO95295 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNAPINO95295 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNAPINO95295 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNAPINO95295 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNAPINO95295 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNAPINO95295 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNAPINO95295 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNAPINO95295 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNAPINO95295 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNAPINO95295 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNAPINO95295 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNAPINO95295 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNAPINO95295 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SNAPINO95295 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNAPINO95295 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNAPINO95295 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNAPINO95295 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNAPINO95295 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNAPINO95295 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAPINO95295 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAPINO95295 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAPINO95295 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAPINO95295 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAPINO95295 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAPINO95295 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAPINO95295 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms