Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBXN7O94888 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125 ms