Protein–RNA interactions for Protein: O88809

Dcx, Neuronal migration protein doublecortin, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DcxO88809 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DcxO88809 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DcxO88809 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DcxO88809 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DcxO88809 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DcxO88809 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DcxO88809 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DcxO88809 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DcxO88809 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DcxO88809 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DcxO88809 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DcxO88809 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DcxO88809 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DcxO88809 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DcxO88809 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DcxO88809 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DcxO88809 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DcxO88809 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DcxO88809 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DcxO88809 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DcxO88809 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DcxO88809 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DcxO88809 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DcxO88809 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DcxO88809 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DcxO88809 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DcxO88809 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DcxO88809 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DcxO88809 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DcxO88809 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DcxO88809 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DcxO88809 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DcxO88809 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DcxO88809 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DcxO88809 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DcxO88809 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DcxO88809 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DcxO88809 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DcxO88809 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DcxO88809 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DcxO88809 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DcxO88809 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DcxO88809 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DcxO88809 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DcxO88809 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DcxO88809 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DcxO88809 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DcxO88809 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DcxO88809 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DcxO88809 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DcxO88809 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DcxO88809 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DcxO88809 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DcxO88809 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DcxO88809 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DcxO88809 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DcxO88809 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DcxO88809 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DcxO88809 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DcxO88809 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DcxO88809 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DcxO88809 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DcxO88809 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DcxO88809 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DcxO88809 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DcxO88809 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DcxO88809 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DcxO88809 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DcxO88809 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DcxO88809 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DcxO88809 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DcxO88809 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DcxO88809 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DcxO88809 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DcxO88809 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DcxO88809 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DcxO88809 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DcxO88809 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DcxO88809 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DcxO88809 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DcxO88809 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DcxO88809 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DcxO88809 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DcxO88809 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DcxO88809 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DcxO88809 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DcxO88809 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DcxO88809 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DcxO88809 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DcxO88809 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DcxO88809 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DcxO88809 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DcxO88809 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DcxO88809 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DcxO88809 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DcxO88809 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DcxO88809 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DcxO88809 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DcxO88809 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DcxO88809 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms