Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
BlmO88700 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
BlmO88700 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
BlmO88700 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
BlmO88700 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
BlmO88700 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
BlmO88700 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
BlmO88700 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
BlmO88700 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
BlmO88700 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
BlmO88700 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
BlmO88700 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
BlmO88700 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
BlmO88700 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
BlmO88700 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
BlmO88700 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
BlmO88700 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
BlmO88700 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
BlmO88700 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
BlmO88700 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
BlmO88700 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
BlmO88700 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
BlmO88700 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
BlmO88700 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
BlmO88700 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
BlmO88700 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
BlmO88700 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
BlmO88700 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
BlmO88700 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
BlmO88700 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
BlmO88700 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
BlmO88700 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
BlmO88700 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
BlmO88700 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
BlmO88700 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
BlmO88700 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
BlmO88700 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
BlmO88700 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
BlmO88700 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
BlmO88700 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
BlmO88700 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
BlmO88700 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
BlmO88700 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
BlmO88700 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
BlmO88700 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
BlmO88700 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
BlmO88700 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
BlmO88700 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
BlmO88700 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
BlmO88700 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
BlmO88700 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
BlmO88700 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
BlmO88700 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
BlmO88700 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
BlmO88700 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
BlmO88700 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
BlmO88700 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
BlmO88700 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
BlmO88700 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
BlmO88700 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
BlmO88700 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
BlmO88700 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
BlmO88700 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
BlmO88700 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
BlmO88700 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
BlmO88700 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
BlmO88700 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
BlmO88700 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
BlmO88700 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
BlmO88700 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
BlmO88700 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
BlmO88700 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
BlmO88700 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
BlmO88700 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
BlmO88700 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
BlmO88700 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
BlmO88700 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
BlmO88700 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
BlmO88700 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
BlmO88700 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
BlmO88700 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
BlmO88700 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
BlmO88700 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
BlmO88700 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
BlmO88700 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
BlmO88700 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
BlmO88700 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
BlmO88700 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
BlmO88700 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
BlmO88700 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
BlmO88700 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
BlmO88700 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
BlmO88700 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
BlmO88700 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
BlmO88700 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
BlmO88700 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
BlmO88700 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
BlmO88700 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
BlmO88700 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
BlmO88700 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms