Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ComtO88587 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ComtO88587 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ComtO88587 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ComtO88587 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ComtO88587 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ComtO88587 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ComtO88587 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ComtO88587 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ComtO88587 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ComtO88587 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ComtO88587 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ComtO88587 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ComtO88587 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ComtO88587 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ComtO88587 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ComtO88587 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ComtO88587 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ComtO88587 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ComtO88587 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ComtO88587 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ComtO88587 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ComtO88587 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ComtO88587 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ComtO88587 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ComtO88587 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ComtO88587 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ComtO88587 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ComtO88587 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ComtO88587 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ComtO88587 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ComtO88587 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ComtO88587 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ComtO88587 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ComtO88587 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ComtO88587 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ComtO88587 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ComtO88587 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ComtO88587 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ComtO88587 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ComtO88587 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ComtO88587 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ComtO88587 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ComtO88587 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ComtO88587 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ComtO88587 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ComtO88587 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ComtO88587 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ComtO88587 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ComtO88587 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ComtO88587 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ComtO88587 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ComtO88587 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ComtO88587 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ComtO88587 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ComtO88587 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ComtO88587 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ComtO88587 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ComtO88587 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ComtO88587 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ComtO88587 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ComtO88587 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ComtO88587 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ComtO88587 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ComtO88587 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ComtO88587 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ComtO88587 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ComtO88587 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ComtO88587 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ComtO88587 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ComtO88587 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ComtO88587 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ComtO88587 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ComtO88587 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ComtO88587 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ComtO88587 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ComtO88587 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ComtO88587 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ComtO88587 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ComtO88587 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ComtO88587 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ComtO88587 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ComtO88587 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ComtO88587 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ComtO88587 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ComtO88587 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ComtO88587 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ComtO88587 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ComtO88587 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ComtO88587 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ComtO88587 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ComtO88587 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ComtO88587 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ComtO88587 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ComtO88587 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ComtO88587 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ComtO88587 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ComtO88587 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ComtO88587 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ComtO88587 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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