Protein–RNA interactions for Protein: O88554

Parp2, Poly [ADP-ribose] polymerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp2O88554 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Parp2O88554 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Parp2O88554 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Parp2O88554 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Parp2O88554 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Parp2O88554 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Parp2O88554 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Parp2O88554 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Parp2O88554 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Parp2O88554 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Parp2O88554 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Parp2O88554 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Parp2O88554 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Parp2O88554 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Parp2O88554 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Parp2O88554 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Parp2O88554 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Parp2O88554 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Parp2O88554 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Parp2O88554 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Parp2O88554 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Parp2O88554 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Parp2O88554 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Parp2O88554 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Parp2O88554 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Parp2O88554 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Parp2O88554 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Parp2O88554 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Parp2O88554 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Parp2O88554 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Parp2O88554 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Parp2O88554 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Parp2O88554 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Parp2O88554 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Parp2O88554 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Parp2O88554 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Parp2O88554 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Parp2O88554 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Parp2O88554 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Parp2O88554 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Parp2O88554 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Parp2O88554 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Parp2O88554 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Parp2O88554 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Parp2O88554 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Parp2O88554 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Parp2O88554 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Parp2O88554 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Parp2O88554 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Parp2O88554 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Parp2O88554 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Parp2O88554 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Parp2O88554 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Parp2O88554 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Parp2O88554 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Parp2O88554 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Parp2O88554 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Parp2O88554 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Parp2O88554 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Parp2O88554 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Parp2O88554 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Parp2O88554 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Parp2O88554 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Parp2O88554 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Parp2O88554 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Parp2O88554 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Parp2O88554 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Parp2O88554 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Parp2O88554 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Parp2O88554 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Parp2O88554 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Parp2O88554 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Parp2O88554 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Parp2O88554 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Parp2O88554 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Parp2O88554 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Parp2O88554 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Parp2O88554 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Parp2O88554 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Parp2O88554 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Parp2O88554 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Parp2O88554 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Parp2O88554 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Parp2O88554 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Parp2O88554 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Parp2O88554 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Parp2O88554 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Parp2O88554 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Parp2O88554 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Parp2O88554 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Parp2O88554 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Parp2O88554 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Parp2O88554 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Parp2O88554 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Parp2O88554 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Parp2O88554 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Parp2O88554 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Parp2O88554 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Parp2O88554 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Parp2O88554 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms