Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tnnt1O88346 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tnnt1O88346 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tnnt1O88346 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tnnt1O88346 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tnnt1O88346 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tnnt1O88346 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tnnt1O88346 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Tnnt1O88346 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tnnt1O88346 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tnnt1O88346 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tnnt1O88346 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tnnt1O88346 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tnnt1O88346 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tnnt1O88346 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Tnnt1O88346 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tnnt1O88346 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tnnt1O88346 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tnnt1O88346 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tnnt1O88346 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tnnt1O88346 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tnnt1O88346 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tnnt1O88346 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tnnt1O88346 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tnnt1O88346 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tnnt1O88346 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tnnt1O88346 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tnnt1O88346 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tnnt1O88346 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tnnt1O88346 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Tnnt1O88346 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tnnt1O88346 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tnnt1O88346 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tnnt1O88346 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tnnt1O88346 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tnnt1O88346 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tnnt1O88346 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tnnt1O88346 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tnnt1O88346 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tnnt1O88346 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tnnt1O88346 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tnnt1O88346 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tnnt1O88346 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tnnt1O88346 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tnnt1O88346 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tnnt1O88346 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tnnt1O88346 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tnnt1O88346 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tnnt1O88346 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tnnt1O88346 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tnnt1O88346 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tnnt1O88346 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tnnt1O88346 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tnnt1O88346 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tnnt1O88346 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tnnt1O88346 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tnnt1O88346 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tnnt1O88346 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tnnt1O88346 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tnnt1O88346 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tnnt1O88346 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tnnt1O88346 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tnnt1O88346 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tnnt1O88346 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tnnt1O88346 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tnnt1O88346 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tnnt1O88346 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tnnt1O88346 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tnnt1O88346 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tnnt1O88346 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tnnt1O88346 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tnnt1O88346 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tnnt1O88346 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tnnt1O88346 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tnnt1O88346 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tnnt1O88346 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tnnt1O88346 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tnnt1O88346 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tnnt1O88346 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tnnt1O88346 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tnnt1O88346 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tnnt1O88346 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tnnt1O88346 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tnnt1O88346 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Tnnt1O88346 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Tnnt1O88346 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tnnt1O88346 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tnnt1O88346 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Tnnt1O88346 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tnnt1O88346 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tnnt1O88346 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tnnt1O88346 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tnnt1O88346 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Tnnt1O88346 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tnnt1O88346 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tnnt1O88346 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Tnnt1O88346 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tnnt1O88346 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tnnt1O88346 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tnnt1O88346 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms